GUI(Gnome)で特定のアプリケーションを起動する時にsudoするには

gksuを使う。旧名(?)はgnome-sudo。

gksu gnome-ppp

もっとも、専らGnomeランチャへの追加とかに使う。Gnomeランチャにsudoで追加すると当然のようにというかパスワードを入力する術がないので起動しない。